Operační a vyšetřovací endoskopy jsou běžně rozšířenými zdravotnickými prostředky. Jejich použití nese s sebou významnou zátěž z hlediska rizika možného přenosu nozokomiálních infekcí. V posledních letech došlo ke změnám v doporučených postupech ošetřování jednotlivých typů endoskopů a k rozšíření spektra dezinfekčních přípravků zajišťujících řádné ošetření endoskopů. V ČR platí vyhl. MZ ČR č. 306/2012 Sb., o podmínkách předcházení vzniku a šíření infekčních onemocnění a o hygienických požadavcích na provoz zdravotnických zařízení a ústavů sociální péče. Odborné společnosti: Společnost nemocniční hygieny a epidemiologie ČLS JEP a Gastroenterologická sekce sester při ČAS vydávají společný postup, který respektuje platnou legislativu a návody výrobců.